Losy Papieskiego Wydziału Teologicznego są skomplikowane ze względu na zmieniające się realia polityczne, m.in. przesunięcia granic i zmiany ustrojów. Po wojnie teologia nie znalazła swojego miejsca na odrodzonym Uniwersytecie Wrocławskim i została przeniesiona na Ostrów Tumski - najpierw do Metropolitalnego Wyższego Seminarium Duchownego, a potem zaczęła funkcjonować jako samodzielna jednostka akademicka.